A Villányi-hegység északi oldalán, Vokánytól nyugatra fekvő község. Zsáktelepülés, közúton csak Vokányon keresztül érhető el, az 5711-es útból kiágazó 57 114-es számú mellékúton.

Vonattal elérhető a Pécs–Villány–Magyarbóly-vasútvonalon. Kistótfalu megállóhely a belterület keleti szélén helyezkedik el, közvetlenül a faluba vezető bekötőút vasúti keresztezése mellett.